أنشأ القسم : عام 1999م ابتداء – بالدفعة (21) – نشأ القسم لكى يلبي حاجة المجتمع المحلى والقومي لأطر صحية تقوم بتقديم خدمات الصحة النفسية المتخصصة بكافة أوجها ( وقائية ، علاجيه ، تعزيزيه ، تأهيليه ) .
للقسم صلات مميزة بأقسام مماثله بعدد من الجامعات السودانية ، شكلت تجربه القسم أساسا صلباً دفع عدد من الجامعات لإنشاء أقسام مماثله . وقد كان للقسم إسهاما ًمهما في إعداد مناهج هذه
الأقسام
كما يوجد بالقسم برنامج للدراسات العليا (ماجستير _ ودكتوراة)
تعاقب على القسم عدد من الرؤساء الذين كانت لهم بصماتهم وهم :
بروفسير ضياء الدين الجيلى ابوبكر
د.انشراح مصطفى ابوبكر
د. مودة عثمان عبد الله